Anualmente, para lograr el óptimo desarrollo del proceso del Premio Nacional de Exportación, se conforma una Comisión de Evaluación (Consejo Consultivo de Evaluación) que es la encargada de analizar y emitir calificaciones sobre las empresas, instituciones, organismos y cadenas o alianzas que se registren en el Premio. Esta Comisión contará con Grupos de Trabajo que evaluarán a cada una de las categorías del Premio.

Para formar parte de la Comisión de Evaluación, los miembros deberán ser especialistas destacados en materia de comercio exterior de los sectores público y privado, y deberán registrarse de acuerdo a los lineamientos establecidos en la Convocatoria para Evaluadores 2024 publicada en el Diario Oficial de la Federación.